期刊简介
本刊是由卫生部主管、全国肿瘤防治研究办公室主办的国内唯一一本肿瘤医学领域综合性月刊。杂志以交流肿瘤防治经验，推广肿瘤科研成果，促进肿瘤防治事业发展为宗旨。主要读者对象为卫生行政管理人员，医学临床、基础、科研、教育工作者。主要报道肿瘤领域重要科研成果和事件，肿瘤防治方针政策，筛查方案，卫生经济，肿瘤发病、死亡数据、死因登记、医院管理、临床与基础工作总结。我们还开辟了“药品器械”栏目，介绍药物器械生产厂家及产品的研制、使用状况和临床疗效。在杂志中还可以查阅到未来一段时间国内外会议情况及近期国内外肿瘤防治工作动态。
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首页>中国肿瘤杂志
- 杂志名称：中国肿瘤杂志
- 主管单位：中华人民共和国卫生部
- 主办单位：中国医学科学院（全国肿瘤防治研究办公室）
- 国际刊号：1004-0242
- 国内刊号：11-2859/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：1999-2000年度优秀期刊一等奖期刊收录：CA 化学文摘(美), 万方收录(中), 维普收录(中), 国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 上海图书馆馆藏, 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊)
利用公共数据深入挖掘食管鳞状细胞癌候选肿瘤抑制基因
孙玉琳；陈万青；赵晓航
关键词：食管癌, 肿瘤抑制基因, 公共数据库
摘要：[目的]自20世纪90年代开始,人们利用杂合性缺失(loss of heterozygosity,LOH)技术寻找引起食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)癌变的肿瘤抑制基因.但除了TP53 、CDKN2A等以外,目前很多高频LOH区域的抑癌基因仍未发现.随着近年来生物学信息公共数据库的建设发展,有必要重新筛选分析ESCC中的潜在抑癌基因.[方法]利用Pubmed检索1991～2012年间的食管癌LOH文章,整理信息,综合考虑LOH频率和文献重复鉴定次数后,利用Circos软件绘制并确认了ESCC中高度可信LOH热点区域.对每一区域,利用人类基因组数据库、肿瘤抑制基因数据库和人类蛋白质图集数据库分析其中的候选抑癌基因.[结果]基于85篇针对ESCC的LOH相关文献,共确定10个ESCC高度可信LOH热点区域,主要累及3p、5q、9p、13q、17p、17q等染色体臂.基于3个公共数据库的分析,在每个区域中均确定了一个以上的候选抑癌基因,其中很多基因从未在ESCC中受到关注.[结论]综合考虑文献中对LOH区域的可重复鉴定性可避免原始文献质量和样本选择偏倚等的干扰.利用公共数据库深入挖掘ESCC中的候选抑癌基因,为后续选择合适的靶基因开展深入的表达和功能分析提供了理论依据.
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